@pysam
Pysam 是一个用于读取、操作和写入基因组数据集的 Python 模块。使用 htslib 的 Pythonic 接口读取/写入 SAM/BAM/CRAM 比对文件、VCF/BCF 变体文件和 FASTA/FASTQ 序列。查询 tabix 索引文件,执行覆盖率的堆积分析,并执行 samtools/bcftools 命令。
Pysam 是一个用于读取、操作和写入基因组数据集的 Python 模块。使用 htslib 的 Pythonic 接口读取/写入 SAM/BAM/CRAM 比对文件、VCF/BCF 变体文件和 FASTA/FASTQ 序列。查询 tabix 索引文件,执行覆盖率的堆积分析,并执行 samtools/bcftools 命令。