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使用 Cutadapt(精确、灵活)或 Trimmomatic(双端优化)从读数中删除测序适配器。
输出:sample_ReadsPerGene.out.tab,包含列:
例子:
暂无简介
输出示例:
用于群体遗传学分析的 Python 库,具有高效的数组数据结构。
使用 PLINK 1.9 和 2.0 进行文件格式、转换和质量控制过滤。
解析、下载和写入 PDB、mmCIF 和 MMTF 格式的蛋白质结构文件。
测量距离、角度和二面角。叠加结构并计算 RMSD。找到邻近的原子和接触点。
GSEA 使用按统计量(log2FC,有符号 p 值)排序的所有基因,而不是重要基因的子集。它找到成员在排名列表顶部或底部富集的基因集。
该技能涵盖了为 clusterProfiler 结果设计的richplot 包函数:
使用 Biopython 处理双端测序数据(R1/R2 文件)。