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PureCLIP 使用 HMM 对交联位点进行建模，结合富集和截断信号。
识别超级增强子 (SE) - 控制细胞身份基因的大型增强子簇。
bedGraph 是一种文本格式，用于在基因组浏览器上显示连续值数据。常见于覆盖范围、信号强度和分数。
使用 Biopython 高效处理多个序列文件。
列：chrom、start、end、name、score、strand、signalValue、pValue、qValue、summit_offset
使用动态规划算法对齐两个序列（Needleman-Wunsch 用于全局，Smith-Waterman 用于局部）。
使用 samtools 和 pysam 按标志、质量和区域过滤对齐。
